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L'uso principale dell'EDTA magnesio bisodico è come agente chelante per la formulazione di tamponi, detergenti e medicinali.Può formare complessi stabili con ioni metallici, inibendo così l'attività e la reattività degli ioni metallici.Grazie alla sua capacità di legarsi a calcio, magnesio e altri ioni metallici, il disodio di magnesio EDTA è comunemente usato nel trattamento delle acque, nell'industria alimentare, nell'industria farmaceutica e nella ricerca di laboratorio.Inoltre, il disodio di magnesio EDTA può essere utilizzato anche in campo medico per il trattamento di alcuni avvelenamenti da metalli e avvelenamenti da metalli pesanti.Come nutriente oligoelemento, utilizzato in agricoltura.Viene anche utilizzato per eliminare l'inibizione delle reazioni catalizzate da enzimi causate da tracce di metalli pesanti.