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La topologia della membrana del dominio del canale della colicina E1 è stata studiata mediante trasferimento di energia per risonanza di fluorescenza (FRET).Il FRET ha coinvolto un amminoacido fluorescente codificato geneticamente (cumarina) come donatore e un residuo di cisteina etichettato selettivamente legato con DABMI (4-(dimetilammino)fenilazofenil-4'-maleimmide) come accettore FRET.Il residuo cumarinico fluorescente è stato incorporato nella proteina tramite una coppia ortogonale tRNA/aminoacil-tRNA sintetasi che ha consentito l'incorporazione selettiva in qualsiasi sito all'interno del dominio del canale della colicina.Ogni variante ospitava una mutazione di arresto (TAG) per l'incorporazione della cumarina e una mutazione della cisteina (TGT) per l'attaccamento DABMI.Sei distanze intereliche all'interno delle eliche 1-6 sono state determinate utilizzando l'analisi FRET sia per gli stati solubili che per quelli legati alla membrana.I dati FRET hanno mostrato grandi cambiamenti nelle distanze intereliche tra le eliche 3-6 in seguito all'associazione della membrana, fornendo nuove informazioni sulla struttura legata alla membrana del dominio del canale.In generale, le efficienze intereliche cumarina-DABMI FRET sono diminuite in seguito al legame della membrana, basandosi sul modello a ombrello per il canale della colicina.È stato sviluppato un modello provvisorio per lo stato chiuso del dominio del canale sulla base dei dati FRET attuali e precedentemente pubblicati.Il modello suggerisce la disposizione circolare delle eliche 1-7 in senso orario dal lato extracellulare e l'associazione interfacciale della membrana delle eliche 1, 6, 7 e 10 attorno alla forcina transmembrana centrale formata dalle eliche 8 e 9.